"2. Нормально ли загружать данные из Flat файлов? "
Лучше использовать SQL-запросы. Файлы лучше оставить на крайний случай (когда этой информации нет в основной базе). Ну а в остальном - если очень хочется, то можно.

3. Что такое Иерархии? и их нужно определять вручную или єто можно сделать автоматом?
Что такое - лучше почитать в теории, которой в избытке.
Иерархии автоматом определять можно. Для этого используются свойство parent у каджого из Измерений (Dimension).