Проще всего ждать Юкона, там это реализовано в железе, т.е. там есть semiadditive measure

Если серьезно (ведь OLAP для вас не игрушка а орудие труда), то варианта 2.

1. Иметь таблицу фактов на базе SnapShot, т.е. на для каждого листового элемента измерения времени (в конкретном случае месяц, неделя, день), надо иметь в таблице записи не null остатков для каждой комбинации (в вашем случае товара и склада).
И при построении куба делать CustomRollup для измерения времени.


2. Таблицу фактов строить не на остатках а на движениях и использовать СalculatetMember для остатка, ведь физической мерой теперь будет движение а не остаток (этот подход достаточно часто обсуждался здесь на форуме)

И как последнии вариант это комбинация 1 и 2.
В этом случае вы храните остатки не для каждого листового элемента измерения времени, а поднимаетесь выше, а для более детальных остатков комбинируете 1 и 2.