На ютубе и рутрекере нет ничего стоящего по теме MySQL, в книгах рассказывают про общий синтаксис запросов и реляционную алгебру, в лучшем случае покажут примеры запуска в командной строке. Но сегодня ведь никто в командной строке не работает? В MySQL специально Workbench создали, чтобы было удобно работать. Порекомендуйте какие-то обучающие материалы, чтобы примеры работы с БД объяснялись на workbench

Там документация, а не примеры работы с БД через Workbench. Я спрашиваю не про то, что каждая вкладка на панели WB значит и как размер шрифта поменять, а про конкретные практики работы с WB, когда создают БД.

Я имел ввиду обучающий материал, который помогает влиться в работу людям, которые и запросы к БД подзабыли, и с workbench не работали до этого. В оф. документации не понравилось то, что это не обучающий материал, а справочная информация. Там можно прочитать, какие есть окна в интерфейсе и сочетания клавиш, а как со всем этим принято работать не объясняется. К примеру, в программировании есть похожие на WB программы, которые позволяют упростить работу. Человек, который до этого не имел дело ни с IDE, ни с программированием может начать писать код, размещая все классы в одном проекте, где создал всего один пакет. Или, еще лучше - писать все классы в одном файле. Правильное именование классов и переменных - это отдельное искусство. Комментирование, форматирование текста программ - тоже отдельная тема. Все эти аспекты и называются "best practices".
В WB меня интересует прежде всего не то, как там шрифт править и как обучиться использовать все возможные способы для подключения к базе, а то, как минимизировать написание команд от руки, какие галочки нужно проставить, чтобы большую часть запросов генерировала сама программа WB

Ну какой-то минимальный облегчающий жизнь функционал WB все же должна предоставлять. Скажем, во всех IDE есть кнопки, куда можно нажать и автоматически сгенерируется конструктор класса, геттеры и сеттеры полей, сигнатуры интерфейсов и классов, от которых производится наследование, по щелчку на кнопке генерируются обработчики исключений, имеется механизм автоматический подстановки ключевых слов