Существует запрос
insert into Statistics.TIP_Hosts_200309
(f_service,f_loginsrc,f_logindst,f_typesrc,f_typedst,fsrc,fdst,finb,foutb,fdate)
select 24,f_loginsrc,f_logindst,f_typesrc,f_typedst,fsrc,fdst,sum(finb),sum(foutb),fdate
from Statistics.TIP_NetFlow_200309 where fdate=20030912
group by concat(f_loginsrc,':',f_logindst,':',f_typesrc,':',f_typedst,':',fsrc,':',fdst)

можно ли его оптимизировать как-нить?
Например:
insert into Statistics.TIP_Hosts_200309
(f_service,f_loginsrc,f_logindst,f_typesrc,f_typedst,fsrc,fdst,finb,foutb,fdate)
select SQL_BIG_RESULT SQL_NO_CACHE 24,f_loginsrc,f_logindst,f_typesrc,f_typedst,fsrc,fdst,sum(finb),sum(foutb),fdate
from Statistics.TIP_NetFlow_200309 where fdate=20030912
group by concat(f_loginsrc,':',f_logindst,':',f_typesrc,':',f_typedst,':',fsrc,':',fdst)

количнство записей по селекту сказать сложно, но в таблице хостов их порядка 3 млн. в день

Увы нет.
последовательное построение нарушит необходимую уникальность.