Рассмотрим простейший случай (без левых/правых джойнов)

Ну скажем есть две таблицы:
1. A с полями id,a1,a1,ref_b
2. B с полями id,b1,b2

Пишем

select *
from a,b
where a.ref_b = b.id

А. тогда тебе надо использовать InnoDB таблицы и конструкцию constraint foregin key.

Подробнее в документации по Mysql:
Create table
InnoDB
foregin key

Цитата из докментации.

"Таблицы InnoDB входят в дистрибутив исходных текстов MySQL, начиная с версии 3.23.34a; они активизированы в исполняемом коде MySQL -Max. Для Windows исполняемые коды -Max находятся в стандартном дистрибутиве.

Если вы загрузили исполняемую версию MySQL, которая включает поддержку InnoDB, следует просто выполнить инструкции руководства MySQL по установке исполняемой версии MySQL. В случае, если у вас уже установлен MySQL-3.23, проще всего установить MySQL -Max, чтобы заменить исполняемый файл `mysqld' соответствующим файлом из дистрибутива -Max. Различными в MySQL и MySQL -Max являются только исполняемые файлы сервера. См. разделы section 2.2.10 Установка бинарного дистрибутива MySQL и See section 4.7.5 mysqld-max, расширенный сервер mysqld.

Чтобы произвести компиляцию MySQL с поддержкой InnoDB, загрузите MySQL-3.23.34a или более новую версию с http://www.mysql.com/ и настройте MySQL при помощи параметра --with-innodb. См. раздел руководства MySQL по установке дистрибутива исходного кода MySQL, See section 2.3 Установка исходного дистрибутива MySQL.

cd /path/to/source/of/mysql-3.23.37
./configure --with-innodb

Чтобы использовать InnoDB, необходимо указать параметры запуска InnoDB в своем файле `my.cnf' или `my.ini'. Самый простой способ внести изменения - добавить в раздел [mysqld] строку

innodb_data_file_path=ibdata:30M"