debloggerКак имитировать реф на myisam чтобы в таблице сохранить достаточные сведения для связи с другими таблицами в приложении?
Хранить связи в голове. Как и большинство других разработчиков, которые намеренно не создают связи в базе.
В чем проблема вообще? Не можете сами с собой договориться что по чем связывать?

deblogger, блокнотик, доска для рисования, цветные мелки. ну и тд.
Это вопросы проектирования и культуры. Поэтому и существует куча программ для проектирования баз, а в myisam ничего по сути нет.

авторЗачем мне прописывать в кодах типовые джойны и контролировать их количество, если любая баба, ну, то есть программа способна это сделать без моего участия.
Потому что это все равно придется делать.
Допустим, немного времени они сэкономят, но без понимания как работает и без возможности написать ручной джоин реальный проект и программист завязнет.

Если вы такой абстрактно-ориентированный, зачем вам вообще думать о myisam ?
Используйте SQL. Сейчас в новых версиях движок хранения по-умолчанию сменили на innodb. Документацию по mysql не читайте - читайте Дейта, Кодда и тд.