у меня нет доступа к файловой системе
Ага... у тебя, значит, нет, а у запущенного от твоего имени клиента - есть?
Или ты имеешь в виду, что нет доступа к локальной файловой системе в каталог
secure_file_priv ? тогда это косяк админа - наличие права FILE при отсутствии доступа в каталог выгрузки есть явная небрежность... или у твоей учётной записи нет права FILE? ну так получи - оно же тебе не для баловства...
Или, как советуют выше, обрабатывай полученный tab-delimited файл и заменяй табуляции на что тебе надо.
