Точнее лежит вебсайт. Я думаю, что это связано с mysql.

Локально (и по сети) через mysql клиента все работает нормально. Через apache/php страницы с несколькими селектами висят 10-20-30 минут... Иногда выполняются и страница загружается. Иногда нет.

tcpdump показывает, что постоянно идет какое-то общение между веб и sql серверами.

Диски не нагружены (менее 5ms).
Свободной памяти на обоих серверах предостаточно.

Уже не знаю куда смотреть... Важный вебсайт лежит. Помогите!

В БД одна большая таблица ~170,000,000 строк и десяток мелких. Все запросы идут к большой таблице.
Все клянуться, что ничего не трогали... Само перестало на выходных работать.

[mysqld]
datadir = /var/lib/mysql
socket = /var/lib/mysql/mysql.sock
user=mysql

symbolic-links=0
max_allowed_packet = 256M
default-time-zone = '+00:00'

min_examined_row_limit=1
big-tables
thread_cache_size=6
key_buffer_size = 1G
query_cache_size = 16M
table_cache = 512
max_heap_table_size = 3G
tmp_table_size = 4G
read_buffer_size = 8M

slow_query_log=1
slow_query_log_file=/tmp/slow_query.log
long_query_time=1

[mysqld_safe]
log-error=/var/log/mysqld.log
pid-file=/var/run/mysqld/mysqld.pid
default-time-zone = '+00:00'




| InnoDB | |
=====================================
141001 0:26:18 INNODB MONITOR OUTPUT
=====================================
Per second averages calculated from the last 35 seconds
----------
SEMAPHORES
----------
OS WAIT ARRAY INFO: reservation count 4, signal count 4
Mutex spin waits 0, rounds 20, OS waits 1
RW-shared spins 4, OS waits 2; RW-excl spins 1, OS waits 1
------------
TRANSACTIONS
------------
Trx id counter 0 1792
Purge done for trx's n:o < 0 0 undo n:o < 0 0
History list length 0
LIST OF TRANSACTIONS FOR EACH SESSION:
---TRANSACTION 0 0, not started, process no 31609, OS thread id 140086957553408
MySQL thread id 3644, query id 136269 localhost root
show engine innodb status
--------
FILE I/O
--------
I/O thread 0 state: waiting for i/o request (insert buffer thread)
I/O thread 1 state: waiting for i/o request (log thread)
I/O thread 2 state: waiting for i/o request (read thread)
I/O thread 3 state: waiting for i/o request (write thread)
Pending normal aio reads: 0, aio writes: 0,
ibuf aio reads: 0, log i/o's: 0, sync i/o's: 0
Pending flushes (fsync) log: 0; buffer pool: 0
25 OS file reads, 3 OS file writes, 3 OS fsyncs
0.00 reads/s, 0 avg bytes/read, 0.00 writes/s, 0.00 fsyncs/s
-------------------------------------
INSERT BUFFER AND ADAPTIVE HASH INDEX
-------------------------------------
Ibuf: size 1, free list len 0, seg size 2,
0 inserts, 0 merged recs, 0 merges
Hash table size 17393, node heap has 0 buffer(s)
0.00 hash searches/s, 0.00 non-hash searches/s
---
LOG
---
Log sequence number 0 44243
Log flushed up to 0 44243
Last checkpoint at 0 44243
0 pending log writes, 0 pending chkp writes
8 log i/o's done, 0.00 log i/o's/second
----------------------
BUFFER POOL AND MEMORY
----------------------

Total memory allocated 20358952; in additional pool allocated 653312
Dictionary memory allocated 33320
Buffer pool size 512
Free buffers 493
Database pages 19
Modified db pages 0
Pending reads 0
Pending writes: LRU 0, flush list 0, single page 0
Pages read 19, created 0, written 0
0.00 reads/s, 0.00 creates/s, 0.00 writes/s
No buffer pool page gets since the last printout
--------------
ROW OPERATIONS
--------------
0 queries inside InnoDB, 0 queries in queue
1 read views open inside InnoDB
Main thread process no. 31609, id 140086953191168, state: waiting for server activity
Number of rows inserted 0, updated 0, deleted 0, read 0
0.00 inserts/s, 0.00 updates/s, 0.00 deletes/s, 0.00 reads/s
----------------------------
END OF INNODB MONITOR OUTPUT
============================

Вроде разобрался. Точнее разбираюсь. Что-то хитрое творится с сетью или ДНС. mysql не причем.

Спасибо за внимание! :)