Если сервер, на котором крутится SQL server, не является контроллером домена, то можно ограничится локальными учётными записями, и тогда уж точно не понадобиться использовать доменные имена.
Для того же, что бы запускать все сервера под одной учётной записью, вам понадобиться хотя бы односторонний траст. Например, если есть центральный бомен (схема трастов - звезда), то можно наладить доверие ему всех остальных доменов, но не наоборот.
Тогда у Вас появится возможность указать в качестве учётной записи, от имени которой стартуют SQL сервера, запись из центрального домена. Незабудте только прописать для неё права на старт сервиса, локальный вход в систему и включить её в локальную группу NT Администраторы.