Можно в готовом DTS Package
- использовать в Transformation Task для пары столбцов источник-приемник тип преобразования DateTime String, в которм указать формат даты в источнике и приемнике (не будет работать, если источник содержит пустые значения)

- использовать в Transformation Task для пары столбцов источник-приемник тип преобразования ActiveX Script, в которм парсить текущее значение источника и преобразовавать его к универсальному символьному представлению даты 'yyyymmdd hh:mm:ss.sss'

- попробовать изменить формат отображения даты в Regional Settings

PS
Лично я пользуюсь 2-ым способом.

В созданном data import and export wizard-ом DTS Package-е ищите Transformation Data Task (черная стрелка от файла-источника к базе-приемнику) и в ней в закладке Transformation куча этих самых transformation-ов. wizard выбирает тип transformation-а Copy Column. Удалите его и создайте заново, выбрав при этом нужный тип.