Я занимался 1С + MS SQL Server + Terminal Server, никаких особых проблем не ощущал. (9 клиентов, "Торговля и склад","Бухгалтерия"). Тоже была дилема выбора или собственная разработка или почти готовый вариант 1С (у каждой фирмы есть какие-то особенности ведения учета). От первого варианта отказались (хотя вариант был не плохой), пришлось им настраивать 1С. Так получилось что Торговля и Бухгалтерия две разных базы, отсюда возникла проблема синхронизации справочных данных (Номенклатура, Контрагенты и т.д.), пришлось писать процедуру. (пока не жалуются). Доступ к данным можно организовать при помощи ADO, что по началу я и делал, но это геморой. Дело в том что 1С создает поля в базе данных по какому-то алгоритму, хотя логичнее имя поля задать самому. Что касается скорости получения отчетов, то зависит от мощности Server.