Такая же точно была проблемка! (см. тему Помогите лоху! Не хотит долгий запрос выполнять)
Короче, смысл такой: в том приложении, откуда делаешь запрос, найди в свойствах величину задержки, и поставь её побольше или отключи (если получается). Вот например, в Query Analyzer у меня не получилось отключить timeout, поэтому я в свойствах Options/Connection поставил большую задержку (30 000 секунд), и нормально. А если поставить 0, что собственно означает unlimited, то у меня через полминуты всё равно вылезает timeout expired.
А в Access'e задержку можно отключить, это делается в свойствах запроса (в хелпе написано подробно).