Может кто-то уже занимался подобной задачей:
Как организовать периодический BACKUP скрипта хранимых процедур (можно и всей базы) ?
Я слышал, что SQL Server может взаимодействовать с Visual Source Safe. Где бы прочитать что-нибудь по этому поводу ?
Я вижу еще 3 решения, на мой взгляд не очень красивые:
1. Профайлером оттрекать действия EM во время генерации скрипта и попытаться их повторить. Тут можно пропустить что-нибудь, чего в конкретном случае не требовалось делать.
2. Написать программку, которая сама этот скрипт генерит. Нет времени этим заниматься.
3. Можно создать доп. БД, в которую периодически копировать содержимое syscomments из требуемой БД в, скажем, syscomments_backup таблицу. И делать backup уже этой базы.

А может я зря огород горожу и уже есть готовое решение?