А какой тип репликации ты используешь? Грохнуться может, если запускаешь Snapshot-репликацию с предварительным уничтожением целевой таблицы и переписыванием исходной таблицы из источника.
А вообще-то использование Identity вместе с репликацией - не лучшая идея. Для таких целей используется Uniqueidentifier.

Судя по всему, ты используешь мастер репликации. На одном из шагов он спрашивает, нужно ли выполнить предварительное snapshot-согласование. Нужно сказать "нет". Если скажешь "да", то у тебя появляется шанс предварительно уничтожить таблицу и все что с ней связано.