Можно использовать асинхронное или пакетное выполнение запроса.
Если такой возможности нет или не знаешь, то можно поступить так:
Заранее создать таблицу очередь запросов и таблицу результатов запроса.
Для связи запроса и ответа необходимо в этих таблицах предусмотреть специальное поле.

Выполнение запроса разделить на три чести:
1. Клиент помещает текст запроса в очередь запросов и переходит в режим ожидания (см. пункт 3)
2. Сервер периодически опрашивает очередь. Если в очереди есть текст запроса, то сервер удаляет этот запрос из очереди, выполняет и помещает результат в таблицу результатов.
3. Клиент периодически опрашивает таблицу результатов, и если результат есть, то забирает его и удаляет результат из таблицы результатов.