Операционная система "понимает", что MS SQL Server Agent - суть служба "зависимая" от MS SQL Server.

Поэтому - запустит она его сама после автостарта MS SQL Server (если таковой выбран, а если нет - то ругнется в логе, что не может запустить 1 из сервисов, т.к. не запущен "ведущий").

При выгрузке/останове - с точностью до наоборот, но немного "автоматичнее": если сначала "гасить" MS SQL Server, то она сама же "погасит" MS SQL Server Agent, как "зависимый" сервис.

З.Ы. "Учите матчасть, ребята... Там - ТАК спрашивают!!" (с) сов. летчик, вернувшийся из фашистского плена.

Опаньки, прошу прощения...
Не заметил - что вопрос-то изначальный был - про Win98...

спрашивается - "и нахрена?" (на хрена под "игрушечной" ОС - MS SQL Server, да еще и с Agent-ом впридачу?).
чтобы потом по "регистрям" лазить и выискивать порядок запуска приложений, записанных в автостарте?
(знаю, что ключи такие в "регистрях" есть, но искать их, извините - не буду).

Ставьте под NTWS4.0 если "тесно" с ресурсами... ставьте под W2K - если "широко"...
А про Win98 - забудьте, нет такой ОС... и не было никогда... (для тех, кто с MS SQL Server хотел работать).