Есть такая ютила nnCron называется и еще есть *.bat-файлы (либо сценарии). Вот по таймеру и сохранять копии базы данных, хоть через каждые 5 минут, даже если юзер работал, но!!!!!! Обязательно не менее 2-х раз в день делать backup базы, когда пользователь не работает с базой. Например на запуск базы написать батничек где сначала будет идти бэкап, а потом запуск базы. И на выключение компа сделать тоже батник или сценарий, где сначала бэкап, а потом выключение компа. Если комп работает круглосуточно, то nnCron сможет ночью все забэкапить!
По собственному опыту могу сказать, что если однопользовательская базы и "особо" активных исправлений/ввода/редактирования не ведется, то возможно бэкапить базу, даже если юзер в ней сидит, но лучше все же его выгонять. :))

Не вздумай затирать старую копию!!!!!!!! ЛП тебе же сказал, что возможно при копировании повреждение базы! Так что делай минимум 2 копии, в смысле не перезаписывай копию, а делай новую. А еще надежнее, если инфа уж так важна, хранит 5 последних копий базы и переодически катать их на болванку!