1. Для прилинкованных таблиц в группе Users дайте разрешение на изменение макета. Это не изменит реальных прав на доступ к таблицам, но позволит обновлять связи и переподключаться к другому файлу данных любому пользователю, если стратегия БД это предусматривает, а также избавит вас от лишних проблем, например при преобразовании БД к новой версии.
2. Если вы переходите на новую версию постепенно, т.е. одни юзеры работают в старой версии, а другие - в новой, то, естественно, нужно использовать MDW старой версии, только рекомендуют его ужать. В противном случае лучше создать новый MDW с теми же ключами, что и старый, т.к. это может быть причиной лишних проблем. При работе БД в А2000 с MDW от А97 последний быстро "пухнет". Когда мы перешли на новый MDW - разрушений БД стало гораздо меньше (это субьективное наблюдение, но факт на лице).
3. В А97 модули попадают под раздачу прав, а в А2000/2002 - нет. VBA проект надо защищать паролем.
4. Гаврилову... Не знаю, как в А2002, но в А97/2000 сменить владельца БД можно только копированием объектов в новую БД.

А теперь послушаем правильный ответ (а может и ошибаюсь)...
У разных MDW файлов PID всегда совпадает только у группы "Users" и User-a "Admin". PID группы "Admins" зависит от ключей, использованных при создании MDW файла. Если убрать все права у группы "Users" и User-a "Admin", удалить "Admin" из группы "Admins", а также поменять владельца БД, то ваша БД никогда не откроется с другим MDW.

For Serge Gavrilov:
Проверил, работает, спасибо!

CurrentDb.Containers("Databases").Documents("MSysDb").Owner="NewOwner"

Только одно уточнение. Текущий User "Вася" (он же владелец БД) отдает права
User-у "Петя", но назад в том же сеансе вернуть нельзя. Нужно по новой зайти в БД как "Петя" и передать права "Васе".