Вообще-то сложно сделать так, чтобы он не обновлялся. Обычно изменения видны сразу.

Я в таких случаях делал примерно так

1. Пробегаю по всему дереву и запоминаю Node которые Elapсed (или как там оно называется) в массив. А также элемент который выделен.
2. Отключаю обновление TreeView (вроде Me.Painting=false не помню точно)
3. Делаю необходимые изменения в древе.
4. Распахиваю древо там, где оно было распахнуто.
5. Выделяю тот элемент, который был активным.
6. Включаю обновление древа.

Только надо всякие проверки от ошибок использовать, типа остался ли нод, который был распахнут и пр.

Работает быстро.