Блин, ну чём они думают?!!!

IDS 11.50 – What's New – January 2010
External Tables
Load a subset of rows from an external datafile:
INSERT into emp SELECT * from emp_ext where hiredate >= ‘2001/07/01’;

Unload data to an external datafile ( overwrites the existing datafiles! ):
INSERT into emp_ext SELECT * from emp;

ну раз уж идёте по синтаксису SQL - если так хотите, добавьте модификатор для удаления существующих строк.
Или заставьте разработчика сначала сделать DELETE FROM emp_ext...
Да, конечно, без удаления старых данных корректное добавление во внешний файл с совпадением по структуре сделать нереально. Но ежу же понятно - разработчики обязательно где-нибудь захотят воспользоваться совпадением синтаксиса для "тихой" подмены места хранения без смены функциональности...
А тут "INSERT into emp_ext... overwrites the existing datafiles!"
Мрак...