-=Koba=-Ребята может подскажите где можно почитать более полную инфу
По

отправление и получение MQ сообщений из веб приложения на WAS

вводный раздел и пару примеров на русском, далее на английском

1. J2EE-приложение взаимодействует с системами обмена сообщениями (MOM, к которым относится и WebSphere MQ) через единый интерфейс JMS.

Документации и примеров J2EE/JMS достаточно как на русском, так и на английском.
The Java EE 6 Tutorial > Chapter 47 > Java Message Service Concepts
The Java EE 6 Tutorial >The JMS API Programming Model
Работа с JMS сообщениями и MDB в JEE .

2. Доступ к очередям WebSphere MQ из WAS настраивается более чем одним способом, подробности например здесь:
Network Deployment (Distributed operating systems), Version 8.5 > Learn about WebSphere applications > Messaging resources > Interoperation with WebSphere MQ >
Interoperation with WebSphere MQ: Comparison of architectures
У каждого из способов есть свои плюсы/минусы, выбирать нужно по ситуации.
Для начала работы нужно будет понимание основных терминов и принципов WebSphere MQ.