Dima T
ИМХО, все несколько сложнее... Речь идет о несоответствии между числом записей в файле и числом проиндексированных записей и, как следствие, ошибкой при попытке обновить индексы...

Правильное решение может быть только одно - руки оборвать за такие дела!
В противном случае может помочь переиндексация. Но это процесс дительный (чем больше данныхв файле, тем более длительный процесс).

Если надо закачивать данные в гарантированно пустые файлы, то можно сделать "заготовки" необходимого файла и его индекса, положить их в "укромное место". Затем, при необходимости, - заменять копированием существующий файл вместе с его индексом на "заготовки"!