Физически, команда RUN вызывает системную команду cmd.exe (точнее, то, что записано в системной переменной COMSPEC, но обычно там именно ссылка на cmd.exe). У этой команды ограничение на длину равно ограничению на длину для одной команды в FoxPro. Т.е. это чуть больше 8 тысяч символов

Командная подсказка (Cmd. exe) ограничение строки командной строки

Поэтому тоже думаю, что проблема не в самой команде RUN, а либо в способе формирования, либо в полученном синтаксисе.