Если внешняя программа не принимает имя импортируемого файла в качестве параметра, то можно после запуска внешней программы послать её окну последовательность сообщений (с помощью PostMessage() или SendMessage()), соответствующую ручному выполнению импорта. Если же эта программа ещё и сообщения не обрабатывает, то можно полностью имитировать нажатия клавиш с помощью keybd_event(). Всё это - API-функции, так что вопрос не совсем по Фоксу.