Возможно, где-то осталась ссылка. Т.е. раньше она была, потом ее удалили. Но эта "удаленаая" ссылка физически не удалилась.

Для предотвращения такой ситуации выполни следующее:

1) Удалить этот модуль, затем Project -> CleanUp Project
2) При компиляции EXE обязательно ставь птичку в пункте "Recompile All Files"

Если это не поможет, можно вообще удалить файл проекта (PJX, PJT) и создать его заново.

Если и после этого модуль будет добавляться, значит остались действующие ссылки на этот модуль. Смотри внимательнее исходники.