puls,

Вроде никаких сложностей нет.
Пуск-inetmgr
1 Создаешь не не виртуальную папку, а приложени (а если добавил виртуальную папку - сконверти её в приложение). Указываешь физический путь до места где лежит твой Webservices.
Лучше создать отдельный пул приложения и подвесить твое приложение в этот пул. Если твой WebServices подвиснет, то хотя остальной сайт будет работать.

2 В Basic Settings.. указываешь кнопочкой Connet as ... тип аутентификации Application user(pass-thr...)
3 Дале хлопаешь по твоему виртуальному приложения правой кнопкой и выбираешь Edit Permission, там даешь группе юзверей IIS_IUSRS права на чтение и запуск.

Кажется всё.

puls,
неуверен, но может еще потребоваться следующее:
<ваше вирт. приложение> -> Handler Mapping найти *.wsdl два раза кликнуть проверить путь там должно быть что-то типа такого C:\Program Files\Common Files\MSSoap\Binaries\SOAPIS30.dll
Жмем кнопочку rEQUEST rESTRICTONS -> Access ->Execute.