скорее всего у вас там написано что-то типа

use mytable

так вот этот mytable фокс и не может найти (ищет в текущем пути)
а текущим является... а вот х\з какой, скажем если вы с ярлыка запускались то тот который указан в св-вах ярлыка как "рабочая директория"

в дебаге скорее всего работает, т.к. при запуске фокса методом даблклика по проекту фокс выставляет рабочую директорию на проект.

собственно, что делать, ну обычно что-то типа:
Public cPath
cPath = Sys(5)+Curdir() && Путь к текущей папке

и

SET PATH TO &cPath ADDITIVE && чтоб сказать фоксу что искать в т.ч. по этому пути и тогда можно будет опускать полный путь

или

use (cPath + "myTable") in 0 && с указанием полного пути к таблице... мне так нравится больше