Вообще-то, тебе уже "намекнули", но уж слишком "прозрачно". Поясняю.

В какой именно рабочей области будет открыта таблица по команде SELECT ... INTO ... никогда заранее неизвестно.

Поэтому твой уверенность, что таблица будет открыта именно во 2 рабочей области, мягко говоря, удивляет.

Вообще, обращение к рабочим областям по их номерам - это крайне порочная практика. Требует повышенной бдительности от программиста и в подавляющем большинстве случаев ничем не оправдана.

Следует использовать переход в нужную рабочую область по алиасам открытых в них таблиц. В твоем случае

nonentityсам проект находится на диске d, там же находится и таблица temp, но результат запроса направляется на с в дирректорию, где установлен FoxPro.
В целом, leaf - прав, но он опять не сделал никаких пояснений.

При использовании синтаксиса

SELECT ... INTO TABLE temp

будет создана новая таблица. Причем в данном случае она будет создана в текущей директории. Какая именно директория является в данный момент текущей можно определить так:

?FULLPATH("")

Здесь пустая строка (две кавычки подряд) в качестве параметра обязательна.

Изменить текущую директорию можно используя команду

SET DEFAULT TO "D:\MyDir"

или

CD "D:\MyDir"

Но можно просто явно указать в команде Select-SQL где именно создать новую таблицу:

SELECT ... INTO TABLE D:\MyDir\temp

Впрочем, обычно в этом не возникает необходимости, поскольку если запустить скомпилированный файл EXE непосредственно из проводника Windows, то в качестве директории по умолчанию и так будет выбрана та директория, где этот файл EXE и расположен. Разумеется, если ты не менял ее каким-либо образом.