Попробовал "финт ушами" провернуть, но он ожидаемо провалился:
Если подсунуть fbclient.dll из Firebird-2.5.5.26952-0_x64 (не Embedded), то indexer запускается, но при выполнении sql_query запроса на выборку данных для создания индекса падает, так как там хранимая процедура использует UDF. Соответствующая udf лежит на диске в каталоге \udf

Прошу прощения, мозги у меня видимо неправильной разрядности в выходные.
UDF конечно же 32х разрядные и в папке с приложением была сборная солянка файлов FireBird Embedded (разной разрядности).
Все почистил, скопировал 32х разрядный FB Embedded и 32х разрядный Sphinx. В такой конфигурации Indexer запускается и работает. Если попытаться использовать Indexer из 64х разрядной сборки - падает с указанной выше ошибкой.
В принципе, для моей задачи скорее всего хватит 32х разрядного Сфинкса (64х разрядный мы использовали на больших объемах данных, когда 32х разрядный падал), но чисто для самообразования вопрос: почему Sphinx x64 падает при использовании FB Embedded x32 ?

hvlad, Arioch спасибо за помощь!