gdb - это название файлов баз данных, пришедшее по наследию от интербейза. Вобще плевать как файл называется, хоть txt. Главное - это содержимое файла. Расшиение gdb виндой где-то используется, поэтому, для ясности, решили назвать базы FB fdb, а последних версий ИБ - ib.

авторИ чем лучше редактировать *.fdb ?

Та хоть блокнотом Конечно напрямую их лучше не трогать. Их пускай сервер редактирует. Ставишь сервер, ставишь IBExpert, подключаешся экспертом к базе и делаешь что тебе надо.
Вот если база у тебя испортиться, тогда можно всякими IBSuregon чюдеса с базой вершить, но лучше до этого не доводить...