> Что-то вроде killall -9 gds_inet_server
Я так понял здесь подразумевается классик сервер? Может и не сработать. Классик обычно запускается из inetd (или xinetd) как сервис по запросу (Я только SS пользую. А CS - он вообще как отдельный демон запускается?) . В этом случае, как только вы прибьете gds_inet_server, он снова будет перезапущен inetd-ом (xinetd-ом) Поэтому нужно убрать состветсвующие записи из inetd.conf (или xinetd.conf) и послать сигнал HUP inetd (xinetd)

Если имеется ввиду SS, то желательно останавливать через ibmgr (или fbmgr для FB 1.5). Здесь два варианта:
1) Установить переменные окружения ISC_USER и ISC_PASSWORD и запустить ibmgr -shut (fbmgr -shut):
(для bash)
export ISC_USER = sysdba
export ISC_PASSWORD=????
ibmgr -shut

2) Запустить ibmgr. Затем последовательно набрать
IBMGR> user sysdba
IBMGR> password ????
IBMGR> shut
IBMGR> quit

А вообще с Firebird-ами поставляются специальные скрипты, с помощь которых можно запустить/остановить ibserver (fbserver)