Блок А.Н.Ну, я так понимаю, она глобалы собирает в кучу и по порядку блоков.
Когда-то переписывался с IS и мне присоветовали ^GBLOCKCOPY в том числе и файл сжимает и глобалы собирает в кучу и по порядку блоков. Пользуюсь с 2009 каше.
Про ^DATABASE сказали:
авторCompact из ^DATABASE может сделать частичную дефрагментацию базы в той счастливой ситуации, когда есть свободные блоки между блоками одного глобала. Но это редкая ситуация, т.к. обычно свободные блоки занимаются другими глобалами. В таком случае ничего не делается.

GBLOCKCOPY - это полная дефрагментация. Т.к. по порядку идет по списку глобалов и для каждого переносит все его блоки, потом приступает к следующему глобалу.