Прежде, чем определятся со стратегией тестирования, давайте определимся с терминологией.
Не думаю, что Вы имеете возможность выбора между черным и белым ящиком (Коллеги из MS задают более четко сформулированные вопросы ). Поэтому рискну предположить, что Вам для начала нужно составить план тестирования. (Разницу между стратегией и планом можно увидеть по приведенном мною ссылкам.
Далее Вам нужно создать набор тест-кейсов. Для начала придумайте тест кейсы для следующих особенностей:
Features of the data flow task

SSIS provides the following built-in transformations:

* Conditional split
* Multicast
* Union-All, Merge, and Merge Join
* Sort
* Fuzzy Grouping.
* Lookup and Fuzzy Lookup
* Percentage Sampling and Row Sampling
* Copy/Map, Data Conversion, and Derived Column
* Aggregation
* Data Mining Model Training, Data Mining Query, Partition Processing, and Dimension Processing
* Pivot and
* Slowly Changing Dimension
* Script Component
Документация по продукту - кладезь вдохновения для создания тест-кейсов.