Обучение сотрудника проходит как услуга сторонней фирмы, оплачивается по договору. Требуете счет-фактуру, бухгалтерия оплачивает, и все. Никаких 13% не вычитается. Для работника фирмы никаких неудобств нет.

Если платите сами, как физ лицо, то возможно смотреть в другую сторону - компенсацию налоговых отчислений. Но я не уверен что курсы зачитываются за обучение аналогично получению высшего образования или аспирантура.

У вас там хто в бугалтерии работает??? Какой подоходный налог за курсы? "Подоходный" - само название говорит за себя - налог взимается с полученных доходов. Какие доходы Вы получите при обучении? Какой еще налог?

Обычно учебные центры располагают типовым договором на обучение/курсы, могут вписать фамилию, могут и нет. Это не важно. Лицензия на проведения обучения быть должна, бухгалтерия может запросить еще дополнительные материалы - устав организации и т.д.

Я рискну предположить что возможно Вы не совсем верно поняли слова бухгалтерии, либо там девочка совсем юная нихрена не знает.