Для правильного ответа на вопрос нужно знать, что подразумевается под словом "круче"?
С# является продуктом Microsoft и может быть изменен, как пишется обычно в лицензиях, в любой момент без уведомления пользователя. C# более более Windows-ориентированная. С Java ситуация несколько иная. Если я не ошибаюсь, Java более открытая, и ее развитие обсуждается сообществом заинтересованных фирм и разнаботчиков.
Поэтому обычно крупные фирмы чаще выбирают Java в качестве инструмента разработки.