Morskoi_kotik,
У Вас в таблице посещаемости будет одна и та же дата фигурировать по многу раз, как и ID занимающегося. Другой вопрос, что каждое сочетание "дата - ID занимающегося" должно быть уникальным, по идее. Ведь один человек ходит на кружок один раз в день. Если же занятия кружка проходят несколько раз в день, и один человек посещает не одно занятие конкретного кружка в день, а несколько (неважно по каким причинам) и Вы хотите и это тоже отслеживать, тогда надо добавить поле времени начала занятия или поле номера занятия кружка или что там у Вас есть.
У Вас дата - это атрибут, а не сущность, так что всё в порядке. А то можно начать переживать ещё по поводу "АААА! У меня один человек ходит на один и тот же кружок двадцать раз в год! Не нарушит ли такая куча одинаковых pupil_id 3НФ? Что делать?". Всё в норме и с датами, и с pupil_id, не переживайте. Людей как сущность в отдельный справочник вынесли, и это правильно, и достаточно.

Ну и если кружков несколько, тогда добавьте ещё в таблицу поле с id кружка.

Это вариант строить таблицу типа pupil_id,дата1,дата2,дата3 - глупость и идиотизм, а у Вас всё верно.
А если нужно будет получить отчёт вида pupil_id,дата1,дата2,дата3 - то его при помощи Pivot можно сделать из Вашей таблицы.