Я так понимаю всё рабочее уже? Иначе бы не возникло вопроса...
По идее (если в кратце), услуги, абонементы, сертификаты и прочее можно объединить в одну сущность с признаком что это такое (например через классификатор: 1- услуга, 2 - сертификат, 3- абонемент и т.д.) а потом включать нужные алгоритмы обработки в соответствии с признаком из числа существующих.
Естественно некоторые ветви в общей структуре будут не задействованы для отдельных типов, например для услуг не будет прихода как для товара (только корректировка самих услуг: добавление, удаление, корректировка цены).
Насколько это оправдано судить вам, будет одна структура и добавление нового типа повлечет добавление нового типа в классификатор и новых алгоритмов его обработки (если они отличаются от уже существующих), в принципе задача вполне решаемая, будет просто больше нагрузки на интерфейс, имхо почти везде и у всех
так и реализовано (за исключением 1С - там каждый чих это отдельный документ, но и у них это всё таки в одной структуре БД)....