подозреваю, что бэкапа repository должно быть достаточно.

на всякий случай я еще сохраняю FileStore\Input,Output, но не уверен, что это нужно.

насчет бэкапа:
у меня не получалось просто восстановить базу из бэкапа. что-то там не совсем чисто. пришлось делать базу на соседнем сервере, а потом пользоваться "Repository Migration". так надежней.

FileStore стандартно находятся в каталоге Programm Files\Business Objects\...где-то-там

или там, как указано в настройках серверов через Administration Launchpad в разделе Servers.

описочка...

при конфигурации CMS она спрашивает создавать новый repository или копировать из существующего, вот там и указываем соурс параллельного сервера с бэкапной базой.
и, что не маловажно, делать это под sa.