Классы(*.class) лежат в *.jar-архивах в установке паблишера, на сервере, например.
BI Publisher - логическое развитие XML Publisher. Принцип работы и основа у них одна.
XML Publisher входит в поставку OEBS, BI Publisher продается и отдельно и в комплектах Oracle BI *

ArienКак следующая версия?

Скорее, это не версия, а другой продукт. Версии у них считаются по возможностям, встроенным в парсер шаблонов, как правило. И версии XML и BI могут в этом смысле совпадать.
Логическое, потому что XML Publisher как отдельный продукт не продавался и не имел связи с аналитикой.
BI Publisher имеет гораздо больше возможностей, в частности, подключение различных датасорсов - jdbc, oracle bi например. То есть позволяет делать отчеты не только по базе, но и по презентейшен уровню администратора oralce bi, и по его уже готовым аналитическим отчетам - answers.
Да и в целом, сейчас BI Publisher умеет печатать отчеты не только в rtf, pdf, excel и xml, но и в csv и ppt