Жесткий диск может быть разделен на несколько разделов - основной и дополнительный. Только в основном разделе может быть загрузочная область. В дополнительном разделе может быть несколько логических дисков.
В винде ты их будешь видеть как отдельные диски С:, D: и т.д.
Системный диск - тот, с которого может загрузиться комп, т.е. на котором находиться какая-нибуть операционная система

Основной раздел может быть только один на одном физическом диске - его можно считать одним логическим диском.

Наглядную картину можешь увидеть в Управлении диска в xp