Что за сервер то бренд или самосбор? Охлаждение, БП в норме? Может вибрации сильные? Жесткие диски какие берете - "серверных" линеек типа NS у Сигейта или RE у WD?

Так может лучше заказывать не просто сервер, а оговорить SLA и проблемы хостера, что там у него упало, как он это решает и т.п.
По сути, если нормальное охлаждение и питание, плюс железо не старое, то работает все как правило надежно. Бывает конечно, что выходит что-то из строя, но это никак не предугадать, если не было каких-то факторов предвещающих беду.

авторрешает хостер это заменой поврежденного винта. Но за здоровьем винта клиентам нужно смотреть самостоятельно. Т.е. его не поменяют до тех пор пока клиент не попросит сделать проверку винта или не пожалуется на вялую работу сайтов.
Потом идет проверка винтов, если она покажет что винт покрышился, то винт меняют и начинают синхронизацию рей массивов. Формально это гдето до получаса отключенный сервер и до суток торможения сервера на период его синхронизации.
Но если упустить момент и упадут два винта одновременно, тогда совсем печально, меняют два винта, ставят ОС, и разворачивают бекапы. А это гдето 15-25 часов выключенного сервера, в лучшем случае.
У жестких дисков есть характеристика, как MTBF среднее время наработки на отказ, у серверных жестких дисков она больше, чем у десктопных, но естесственно, что это "среднее" и не всегда показатель, у более скоростных жестких дисков вероятность отказа поболее, чем у медленных. Что я Вам могу посоветовать - использовать серверные жесткие диски, использовать хот-спаре диски в массиве, использовать брендовые сервера (там много различных технологий используется - коррекции ошибок, при ухудшении показателей жесткого диска идет превентивный ребилд на хот-спаре, чтобы в случае проблем ребилд занимал меньшее время), если так боитесь двойного отказа использовать более сложные массивы с более высокой отказоустойчивостью, включить мониторинг состояния здоровья системы, чтобы в случае алертов приходили сообщения на электронную почту или смс. Если простои так критичны, использовать частное облако и мигрировать на другой хост в случае проблем, но это уже решать Вам надо по бюджету)

авторНо если исходить из того что предлагает хостер, там на самых дешовых серверах 3 тб винты
Узнайте точную марку и модель тех винтов, которые у него стоят. Может там обычные десктопные винты, а может и серверные, дальше будем думать. Ну поменяете вы на винты меньшей емкости, если они таки же десктопные, то шило на мыло.
P.S У меня большое подозрение, что там дескотпные винты, т.к. серверных винтов на 750, 1,5ТБ я не видел, обычно 1ТБ, 2ТБ и 3ТБ

авторSeagate ST3000DM001-9YN166 - марка и модель винта.
Десктопный винт, вполне возможно не выдерживает нагрузок или условия эксплуатация у хостера не подходящие.
Ищите энтерпрайз решения у Сигейта это ST33000652SS и ST33000652NS если мы о 3ТБ говорим.

авторсапорт предложил два варианта
300 GB SAS (Seagate ST3300657SS) - 15 евро в месяц + обязателен 4-х портовый Hardware RAID - 25 евро в месяц + расширенная настройка (flexi-pack) - 15 евро ежемесячно
600 GB SAS (Hitachi Ultrastar 15K600) - 25 евро в месяц + обязателен 4-х портовый Hardware RAID - 25 евро в месяц + расширенная настройка (flexi-pack) - 15 евро ежемесячно
Ну это уже нормальные корпоративные диски, правда нужна ли Вам такая скорость там на обоих по 15000 RPM. Опять же какие объемы Вам нужны, тоже надо подумать и какой рэйд-массив из них делать.

Узнать есть ли винты на 10К RPM (воткнуть парочку в зеркало емкостью по 900ГБ) или винты NL SAS там и по 4ТБ есть.

авторнам и 300 гб с головой хватит.
Мне еще на другом форуме посоветовали использовать memcached, поможет ли он существенно снизить нагрузку на винт и нужно ли будет под него переписовать скрипты?
А то я читал на хабре там примеры пхп кода с сипользованием кеширования. Хотя находил такие статьи где просто менялись конфиги и все.
По мемкэшу не скажу, я не спец в этой области, это лучше в профильный) Но использование хардварного контроллера тоже положительно скажется на работе винтов, плюс спец алгоритмы SAS, но тем не менее, это не отменяет, что винт может сдохнуть, просто надежность их выше, да и коррекция ошибок тоже лучше работает.