_Ildar_ Yuasa , B.B.Battary ) поставить батареи большой емкости (например: 10-12 А/ч), определит ли ИБП, что батарея теперь большей емокости и будет ли он дольше держать нагрузку?

Автоматически - не определит, свинцовые аккумуляторы никаких средств для этого не содержат.

_Ildar_2) Если не определит, то как заставить его это сделать?

Калибровкой. Батарея полностью заряжается, потом ставится нагрузка примерно на 30% мощности, и всё это добро выдергивается из розетки, и пусть пищит до полного разряда. Единственное, если нагрузкой будет являться компьютер, дата-кабель ИБП из него нужно выдернуть, чтобы ИБП не усыпил комп раньше времени.
После полного разряда процессор бесперебойника запомнит емкость новой батареи.

_Ildar_3) Возможно ли как-то подключить батарейную систему (например APC Smart-UPS RT 48V Battery Pack )?


Если по напряжению подходит, то кустарно прикрутить ее, конечно же, можно. Но смысла не вижу, т.к. если уж решились кустарно прикручивать внешние батареи, то намного дешевле и эффективнее будет просто автомобильные аккумуляторы туда посадить.
В то же время сильно много внешних батарей навешивать не рекомендую. ИБП способен выдавать определенный ток заряда, рассчитанный на штатные батареи, и гроздь аккумуляторов создаст слишком большую нагрузку на цепи заряда.