dma_caviarcaballeroЕсли заказчик новорит что это неправильно значит он должен знать как правильно. Иначе как он определяет что правильно что нет?

по теме - не вижу никаких проблем при правильной организации ИС. Перемещение - одна из самых простых операций - с одного склада списали на другой добавили такое же количество. Первичные документы здесь - внутренние, оформить можно как угодно лишь бы было понятно что куда и в каком количестве перместилось
Это так, но только если в ИС есть то самое место где эти остатки можно уменьшить/увеличить)))
даже не представляю себе складскую или бухгалтерскую ИС где не учитывается количество на складе