manking1) А какие есть книги по логистике на складе и производстве?
2) То есть кто должен определять оптимальное расположение рабочих центров, их функции, стеллажи, ящики в стеллаж и.т.д?
3) Это вручную рассчитывается специалистами или есть автосредства?
4) Как называется это научное направление?

Скажем создали bom модель материалов по mrp, определили что есть материалы, что детали, что готовые узлы, что готовая продукция,
ввели станки, операции на станках, маршрутные карты движения изделия и.т.д.

Есть пространство, здание например такое
http://skladovoy.ru/wp-content/uploads/2014/09/svet_sklad.jpg
Нужно расставить рабочие центры, стеллаж и определить места в стеллажах под ящики.
И выполнить цели:
-минимизировать количество ящиков и маршруты перемещения между РЦ и стеллажами при прохождении изделия.
-определить оптимальное количество станков и стеллажей необходимых для производства указанного ассортимента продукции(с указанном количеством, скажем чтобы самые продаваемые товары производились в большем количестве, менее продаваемые в меньшем)

Это erp mps системы делают?
То есть вкратце, имея ассортимент и спрос на него определить каким должно быть оптимальное-идеальное производство, без ограничения на размер помещения. То есть убрать всё бесполезное(лишние станки, стеллажи, ящики), что мешает эффективному производству, с указанным количеством.
если есть ТП, то все это несложно

да пофиг БОМ, важен ТП
проектирования производственных мощностей для заданной программы производства не такая сложная задача
сложная задача - сведения целей к производственной программе