АБПредлагаю действовать следующим образом. Релизуем при помощи BPM-системы бизнес-процесс отгрузки. У этого процесса будет шаг "поступление платежа", на нем процесс будет замирать в ожидании внешнего сигнала. Такой сигнал может прийти через веб-сервис (это встроенная функциональность BPM-систем). Нам надо только написать довольно несложный код, который будет вызываться из банк-клиента (ну или периодически просматривать платежки в определенном каталоге, куда он их складывает), парсить платежки и вызывать веб-сервис (беря физические параметры обращения из каталога), передавая ему номер договора, название клиента и сумму. В результате процесс будет переходить к следующему шагу. Этот же процесс будет взаимодействовать с нашей 1С или R/3.
Первое возражение предвижу: "нафига козе баян" (BPM еще какой-то придумали, веб-сервис), но все-таки подожду пока кто-нибудь это произнесет
"Клиент-банк" - древняя DOSовская программа с такой же древней звонилкой а-ля UUPC, пишет в какие-то свои таблицы, выводит данные только на локальный принтер, документации нет никакой. А с этим банком мы работаем, потому что там комиссия меньше/приятель в руководстве и т.д.
Так что прикручивайте что хотите, если сможете, и неважно, что там два рубля в месяц проходит, вы же программисты, вот и автоматизируйте. Реальный пример, кстати.

АБКто бы сомневался. Достаточно типичная для нас ситуация. У амеров на том же месте мэйнфрейм и терминал 3270. И что, думаете они плачут в жилетку? Черта с два! Я видел софт, который позволяет взять вот такую чудо-программу (как есть, без исходников), при помощи визуального редактора привязаться к клавиатурному буферу как входу и к экрану как выходу и сделать из нее веб-сервис! Полагаю что в досе такое сделать не сложнее -- там по крайней мере есть видеобуфер, но что-то пока ничего подобного найти не удалось. Вот думаю самим что ли разработать такую тулзу... Она вашу проблему с досовым банк-клиентом решила бы на раз-два. Конечно небесплатно :)
Проблема решилась проще - сравнением затрат времени операционистки и времени на разработку :).
Я немного о другом хотел сказать, унификация (в том числе обмена данными между сервисами) становится востребованной, когда дает бизнесу конкурентные преимущества. Возьмите, например, любую крупную торговую площадку, там у продавцов очень быстро приходит понимание, что работать надо по определенным правилам, и все правильные слова про веб-сервисы очень быстро становятся понятными. Но это пока в зачаточном состоянии, увы.