в принципе такая задача решается в любой мало-мальски нормальной СУБД,
при желании можно даже в ms access, по крайней мере складской и денежный учет вообще просто делается мы его на занятиях со студентами рассматривали и в двух конторах внедрили, сложнее с заявками - заказами но не думаю что это будет слишком сложно, по крайней мере схему данных я себе примерно представляю так: таблицы: ШапкиЗаявок (содержит дату заявки, номер, ссылку на клиента, срок поставки и т.д); ТабличнаяЧастьЗаявок (содержит ссылку на запись в шапке, список товаров, кол-во, цену и ссылку на партию гасящую эту заявку); ШапкиПриходныхНакладных (дата, номер, поставщик); ТабличнаяЧастьПриходныхНакладных(ссылка на шапку, товар, цена, кол-во, ссылка на заявку). При приходе товара создается запись в табл. ШапкиПриходныхНакладных и записи в ТабличнаяЧастьПриходныхНакладных
При заявках запись в ШапкиЗаявок и записи в ТабличнаяЧастьЗаявок. С некоторой периодичностью(можно после каждого прихода товара) запускается обработка которая будет в ТабличнаяЧастьПриходныхНакладных и ТабличнаяЧастьЗаявок искать одинаковые товары и расставлять ссылки на заявку и на партию. Легко выбрать и товары которые нужно заказать (в ТабличнаяЧастьЗаявок нет ссылки на партию) Дальше дело техники... (тут только про заявки и заказы движение товаров и денег - стандартная задача). Кстати в 1с это тоже делается очень несложно в Тис 7.7 с помощью небольшой доработки, да и в восьмерке тоже думаю проблемы не будут неразрешимыми.