Сообщение "Нарушена целостность структуры конфигурации" появляется, если загружаемая конфигурация совсем убитая, то есть разработчик конфигурации внес такие изменения, что алгоритм загрузки конфигурации, предусмотренный платформой, слетает с катушек. Более того, я считаю, что это фича 8-ки, поскольку в данном случае платформа должна откатиться обратно к живой конфигурации, а не пытаться работать с кривой еще не примененной. Чтобы нормально зайти в конфигуратор для дальнейшей работы со старой версией конфигурации (до момента загрузки кривой конфы) на SQL варианте (SQL-server) достаточно очистить (не дропнуть! а именно очистить!) таблицу config save (таблица для хранения загруженной, но не примененной конфигурации) и дать по шарам программистам, создавшим такой кривой объект.
А разговоры про скачки напряжения - это универсальная отмаза от любых глюков, природа которых не ясна (IMHO).