Особой пользы от того что вы распилите базу на 2 не будет.
А алгоритм примерно такой.
0. Бекап.
1. закомментируем модули проведения всех документов.
2. кладем начальные остатки по регистрам - если в конфе есть соответсвующий документ(ы) то используем их если нет, то создаем такой
табличная часть название регистра, и куча реквизитов неопределенного типа. обработкой получаем остатки на дату светки и заполняем документы. записывем но не проводим.
далее нужно зафиксировать все периодические реквизиты меняемые документами на начало свертки - т.е это будут или документ или просто значение. (т.е. чтобы последнее значение не потерялось после удаления значений до свертки )
3. типовой обработкой (вроде wrap - кладем начальные движения по бухгалтерии)
4. решаем будем или нет резать зарплату
5. смещаем дату ТА в начало времен.
5. помечаем на удаление документы до даты свертки (обычная выборка с исключением документов которые хочется оставить)
6. раскомментируем модуль проведения документов
7. смещаем та на 01.01.12.
8. проводим документы начальных остатков.
9. смещаем та на текущую дату
7. удаляем помеченные на удаление документы через меню операции

А затем, что модуле в процедуре распроведения может быть распроведение подчиненных документов, а они могут лежать другой датой :-)
Или еще чтонибудь не очень хорошее - типа запрета распроведения или отправки письма.