Новобранецбыло нечто похожее X<>X, а именно

остатки на конец периода1 почти по всем счетам не сходились с остатками на начало периода2, период2 следовал за период1, например: 2 квартал после 1-го квартала.

1) пересчет итогов - не помог;
2) индексация (с предварительным удалением всех *.CDX) - не помогла;
3) тестирование и исправление БД - заборола эту непонятность.
было такое...
а мне помогало, как ни странно простая установка расчета бухгалтерских итогов на период до начала работы с базой, полный пересчет, и установка на правильный период