А зачем выгружать базу в SQL? Может лучше сразу связать план счетов в 1С и другой базе?
Из 1С можно получать и записывать данные в другую SQL базу посредством ADO

Написать выгрузку справочников в SQL - проблем нет, нужно их только будет синхронизировать периодически

Используйте ADO. Соответственно, в обработке 1С нужно подключиться к внешней базе данных.
Ну а дальше - insert, update. Единственный минус - нужно на минимальном уровне уметь программировать в 1С. В этом случае логика переноса кодируется в обработке и можно переносить только те поля и записи, которые нужны.
Второй вариант - если база 7.7 - то можно импортировать dbf таблицы справочников в SQL стандартными средствами самого SQL. Только в этом случае придется сохранять структуру таблиц 1С, а она довольна запутанна. Структура таблиц описывается в 1Cv7.DDS базы 1С. На мой взгляд это довольно трудоемкий способ.
Если у вас файловая база 1С 8 - то тут только вариант выгрузки данных из 1С по ADO

Сделать то проще - только потом к ним запросы строить задолбаешься. Имена столбцов и таблиц абсолютно не информативны. Писать такой запрос, а потом и разбираться в нем я никому не пожелаю.

Угу, и наверняка еще какие нибудь траблы будут. Например, с перечислениями. На мой взгляд импортировать таблицы имеет только в одном случае - если нет абсолютно никакой возможности написать обработку по загрузке данных из 1С. Во всех остальных случаях лучше загружать данные из 1С.